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プラグインソースコードを表示するには、プラグインのコードをご覧ください GitHubリポジトリ.

NSGとnsgportalのEEGLAB

EEGLABのオープンポータルを高性能化 コンピューティング: 2018年後半に、ESGLABスクリプトは、Neuroscience Gateway PortalをNSFスポンサーに無料で利用できる高性能コンピューティングリソースで実行できるようになりました。 コメットスーパーコンピュータを参照 サンディエゴスーパーコンピュータセンターを参照 Neuroscience Gatewayのホームページは、以下のとおりです。 NSGアカウントは無料で、米国のユーザーに限定されませんが、ポータルは非商用の目的のためにのみ使用することができる(参照) NSG利用規約).

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全て(個人を除く)のスーパーコンピューターと同様に、Matlabのインタラクティブなスタイルではなく、通常はバッチモードでジョブを実行します。 しかし、コメットには、すべてのMatlab関数とEEGLAB関数と多くのプラグイン拡張機能がインストールされています。 NSGポータルから送信されたジョブが実行されると、NSGからメールを受信して結果をダウンロードします。 これは、Open EEGLABポータルの最良の使用が、複雑な集中的なプロセスや/または、大規模なEEG研究の並列、自動処理のためのものです。 最初のカテゴリでは、我々は今、彗星に最も計算的に集中的なEEGLAB関数をインストールしています: AMICA、RELICA、時間/周波数分析、NFTを介してモデリングするSCALE最適化された個々の被写体ヘッドなど。 インストールした機能を利用することで、より詳細な情報が得られます。

Open EEGLABポータルの詳細な概要を読むには、 会議用紙はIEEE/EMBS神経工学会議に提出しました サンフランシスコ(2019年3月)以降 NeuroImage 記事。

このリポジトリには、REST API: nsgportal を通じて NSG ポータルを横断する EEGLAB プラグインのコードが含まれています。 プラグインのコア機能は、Arnaud Delormeによって最初に作成され、さらに、Ramon Martinez-Cancino、Dung Troung、Scott Makeig(EEGLAB Team)がSDSCのNSGチームから大幅に貢献しました。

バージョン

v1.0 - Neuroimage 2020の記事に使用されるバージョン

v2.0 - 2020年11月NSGオンラインチュートリアルに使用されるバージョン(堅牢性とコマンドラインコールの増加)

v2.1 - Expanse で EEGLAB を使う。 仕事の投稿をブロックしない

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