インストール

神経電磁気 フォワードヘッドモデリング Toolboxはオープンソースです。 MATLAB(Mathworks, Inc.)で動作するソフトウェアツールボックス 利用可能なデータ(MRIおよび/または)から現実的なヘッドモデルを生成する 電極の位置)および前方問題の解決のため 電磁石の源のイメージ投射。 ツールボックスにはツールが含まれています 頭皮、頭皮、cerebrospinalの液体(CSF)および脳のティッシュを分けること T1級磁気共鳴(MR)画像より。 抽出した後 区分されたティッシュの容積、網の生成は行うことができます。 MRの場合 テンプレートヘッドモデルを警戒することができません 電極位置を測定し、より優れた装着ヘッドモデルを得る。 ツールボックスには、電極の頭皮メッシュの共同登録と 脳内の均一なソース空間を生成し、 粗いソース ローカリゼーションで使用される。 境界要素法(BEM)は 前方問題の数値ソリューションに使用されます。 ツールボックス 関数は、グラフィックユーザーインターフェイスまたはから呼び出すことができます。 コマンドライン 機能ヘルプメッセージとチュートリアルが含まれています。ツールボックスは、GNUパブリックライセンスの下で自由にご利用いただけます 非商用利用とオープンソース開発。

ツールボックスは、次のサードパーティのツールとライブラリを使用します。 セグメント化、メッシュ生成およびフォワード問題ソリューション。 ソース これらのツールのコードは利用可能です。

1. ASC - 3Dボリュームの三角化のために。

2\。 Qslim - メッシュ粗加工用。

3\。 Matitk - ITK画像処理ツールキットへのMatlabインターフェイス。

4円 Metu-bem - 境界要素メソッドソルバー。

NFTツールボックスは、セグメンテーション、メッシュ用のユーザーインターフェイス(UI)を提供します 生成と数値ヘッドモデルの作成 それはまたよくあります MATLABコマンド・ライン・インタフェースを定義しました。

このマニュアルでは、NFTツールボックスの使用方法について説明します。 ヘッドモデリングUI、 コマンドライン API と構造を記述します。 会社概要 実装が提供されます。

次のセクションでは、ツールボックスのインストールについて説明します。 取得する インターフェイスの概要を提供するセクションを開始。 ヘッドモデリング 3D MR画像は、次の3D MR画像から記述され、その後、ヘッドモデリングから テンプレートワーピング。 これは、前方モデリングのセクションで続きます 例) ザ [final] セクション](Chapter_05_NFT_Commands_and_Functions “wikilink”)は、 すべてのツールボックス関数とコマンドの概要。

インストールと構成

このセクションでは、NFTのインストールと構成について説明します ツールボックス。 次の手順は、適切なインストールのために必要です ツールボックス:

1円 ツールボックスのディレクトリを抽出またはコピーする コンピュータファイルシステム。

2\。 抽出されたディレクトリには m-files と C++ の実行ファイルが含まれます。

3\。 MATLABパスにツールボックスディレクトリを追加します。 ファイル → setPath メニュー項目または addpath() 関数。 linux/unix では、 MATLABPATH にディレクトリを追加します。

ツールボックスは、Matlab 並列処理ツールボックスの使用も可能です (インストールされている場合) 転送の計算を配布し、 複数のプロセッサへのリードフィールドのマトリックス。 これを行うには、実行前に NFT は、単に入力しなければなりません

>> matlabpool(n) % は、n が利用可能な計算ノードの数です。

並列モードでは、転送を計算している間にバーが表示されないのを待ちます リードフィールドのマトリックス。

始める

ツールボックスはタイピングで始まります コマンドウィンドウのNeuroelectromagnetic_Forward_Modeling_ToolboxまたはNFT。 図1に示すようにメインウィンドウが表示されます。 このウィンドウは分割されます 3つのパネル。 最初のパネルは、作業フォルダを選択するために使用されます。 被写体とセッションの名前を付ける。 NFMツールボックスは、対象を要求します 起動時に指定するフォルダ すべての被写体固有の出力が保存されます このフォルダに。 ファイル名は、対象とセッションから派生します。 このパネルに入力された名前。 2番目のパネルはヘッドモデリングです パネル。 ヘッドモデルは、MRイメージから作成するか、またはMRイメージから作成できます。 テンプレートヘッドモデルは、デジタルセンサーに警告することができます。 ヘッド モデリングパネルは、ヘッドを作成するときに次の操作を提供します MRイメージからのモデル:

*画像のセグメンテーション * 必須

3D MR イメージからの組織の分類のためのインターフェイス。

メッシュジェネレーション

セグメント化結果を使用して、現実的なBEMメッシュを生成します。

Source Space世代

脳メッシュ内の定期的なグリッドソースを生成します。

電極共同登録

電極の位置をスカルプメッシュに登録します。

数値化した電極からテンプレートベースのヘッドモデルを生成するとき 位置、唯一のオプションは、テンプレートワーピングです。 最終的なパネル メインメニューはフォワードモデル生成用です。 フォワードを開く BEM係数を計算するために使用されるモデル生成インターフェイス マトリクスは、各センサーのトランスファーマトリクスを作成し、リードを生成します ソース分布のためのフィールドマトリックス。

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