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プラグインソースコードを表示するには、プラグインのコードをご覧ください GitHubリポジトリ.

マトラボツールボックスとNeuroelectromagneticフォワードヘッドモデリング用のEEGLABプラグイン

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NFTとは?

ネウロエレクトロ磁気 フォワードモデリングツールボックス(NFT)はMATLABツールボックスです 利用可能なデータから現実的なヘッドモデルを生成するための(MRIおよび/または) 電極の場所)および解決のための計算の数値解決のため 電磁波イメージングのフォワードの問題(Zeynep Akalin) Acar&S. Makeig、2010年。 NFTには、スカルプ、スカルプ、スカルプ、 cerebrospinal 流体 (CSF) および T1 級磁気からの脳組織 共鳴(MR)画像。 境界要素法(BEM)は、 前方問題の数値ソリューション。 抽出した後 セグメント化された組織のボリューム、表面 BEM メッシュが生成される場合があります。 いつか MRイメージは使用できません。テンプレートヘッドモデルは警告される場合があります。 3D測定された電極の位置に、個別化したBEMの頭部を得るために モデル。 Toolbox関数は、グラフィックユーザーから呼び出すことができます。 インターフェイス(gui) EEGLAB (sccn.ucsd.edu/eeglab)と互換性がある、またはから MATLABコマンドライン 機能ヘルプメッセージとユーザーチュートリアルは、 含まれる。 ツールボックスは、非商用使用とオープンのために自由にご利用いただけます GNUパブリックライセンスに基づくソース開発

なぜNFT?

NFT はオープンソースライセンスで公開され、研究者が許可する 利益のために仕事に貢献し、改善するために 神経科学コミュニティ。 高度なヘッドモデリングと 問題解決方法および導入を容易に進めて下さい ツールボックスを使うと、NFT は EEGLAB を補完します。 積極的な開発。 組み合わせて、NFT と EEGLAB は、自由に利用できる EEG を形成します (そして将来的に、MEG) の源のイメージ投射の解決。

ツールボックスは、現実的なヘッドモデリングの主要な側面を実装し、 利用できる主題情報からの進む問題の解決:

  1. T1級の区分 MRイメージ: 優先方法 リアルなヘッドモデルを生成し、3D全ヘッドを使用する 被写体のヘッドの構造 MR イメージ。 ツールボックスは生成できます 頭皮、頭皮、CSF、脳組織のセグメンテーション T1級画像。

  2. 高品質 BEMの網: BEMソリューションの精度は、 モデル組織の根底メッシュの品質 導電変化の境界。 数値的な不安定性を避けるため、 メッシュは自己断裁なしで局所的に正しい必要があります。 高品質の要素を使用して表面を表現する必要がありますが、 要素数をできるだけ小さく保ちます。 NFTはできます ヘッドから高品質のリニア表面BEMメッシュを作成する セグメント化。

  3. テンプレートヘッドモデルをワーピング: 全ヘッド構造のMRイメージの場合 被写体が利用できず、半現実的なヘッド モデルは 標準的なテンプレートBEMメッシュをデジタル化に警告することによって生成される 電極座標(その逆に)。

  4. BEMの網が付いている電極の位置の登録: デジタル化 電極の位置と BEM メッシュを計算するために整列する必要があります。 正確な前方問題の解決およびリード フィールドのマトリックス。

  5. 正確な高性能の進む問題の解決: NFT は、 高性能 オープンソース METU-FP による BEM 実装 バイオ電磁分野計算ツールキット。

必要なリソース

Matlab 7.0 以降は、任意のオペレーティングシステム (Linux、Windows) の下で動作します。 大量のRAMが便利です - 少なくとも2 GB(4-8 GB推奨) 現実的なヘッド モデルの前進問題の解決。 Matlabイメージ 処理ツールボックスもお勧めです。

次の3rdパーティプログラムの事前コンパイルされたバイナリが配布されます NFT ツールボックス内でユーザの説得力があります。 バイナリはコンパイルされます 32ビットと64ビットLinuxディストリビューション

これらのプログラムはすべて、オープンソースライセンスを持ち、完全なソースコードを提供します。 各プログラムのホームページをご覧ください。 ソースコードとライセンス情報。

ASC: アダプティブ・スケルトン・クライミング ホームページ: http://www.cse.cuhk.edu.hk/~ttwong/papers/asc/asc.html

QSLIM:Quadricベースの表面の簡素化 ホームページ: http://mgarland.org/software/qslim.html

BEM_MATRIX: METU-FPツールキット ホームページ: http://www.eee.metu.edu.tr/metu-fp/

PROCMESH:網の訂正および処理。 サイトマップ ソースコードについては、NFT開発者にお問い合わせください。

マットラボとITK ホームページ: http://www.sfu.ca/~vwchu/matitk.html

Note: MATITK 共有ライブラリは ‘mfiles’ ディレクトリにインストールされます。

ダウンロード

NFTをダウンロードするには、EEGLABプラグインマネージャを使用します。

NFT ユーザーマニュアル

詳細については、チュートリアルセクションを参照してください。 NFTユーザーマニュアルをPDFブックとしてダウンロードするにはここをクリック

作成と文書による:Zeynep Akalin Acar、[email protected]

サポート: Yayha Shirazi、[email protected]からの限定サポートは利用できます

NFTの特長 参照のペーパー

Zeynep Akalin Acar&Scott Makeig, [Neuroelectromagnetic] - Zeynep Akalin Acar & Scott Makeig フォワードヘッド モデリングツールボックスhttp://sccn.ucsd.edu/%7Escott/pdf/Zeynep_NFT_Toolbox10.pdf). 神経科学研究, 2010

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